尿毒症一般药物治疗效果不佳，可以使用中成药改善症状，但是不能使肾功能衰竭逆转。尿毒症目前最主要的治疗就是血液透析治疗或腹膜透析治疗等替代治疗，透析治疗可以清除体内多余的水分或毒素，但是不能纠正贫血及高磷血症等情况，需要及时补充促红细胞生成素和使用降磷药物。
如果条件允许可以考虑肾移植，肾移植后移植肾可以替代原有肾脏所有的功能，但是肾移植后需要长期使用抗排斥药物治疗。尿毒症的治疗目的就是提高生活质量，防止严重的并发症，从而延长尿毒症患者的寿命，同时尿毒症在透析治疗的同时，注意肾性贫血、肾性骨病及心脑血管等并发症的防治。