基孔肯雅热典型症状主要有发热、皮疹、关节疼痛等，伴有头痛、恶心、呕吐、食欲缺乏，鼻和齿龈出血、胃肠道出血、表浅淋巴结肿大等症状。基孔肯雅热的并发症包括关节僵硬、流产、脑膜炎等。
一、典型症状
1、发热：基孔肯雅热急性起病，多为高热，可伴寒战。一般发热1～7日即可退热，多数患者在体温正常1～3日后再次出现发热，再持续3～5日复常，称为“双峰热”。
2、皮疹：皮疹常出现在发热后2～5日，80%患者可见颜面、躯干、四肢伸展侧及手掌、足底出现红色斑丘疹或猩红热样皮疹，有瘙痒感。
3、关节疼痛：四肢关节及脊椎剧痛多伴随发热出现，亦可一个关节或全身多个关节疼痛，伴肌痛。有的患者往往在数分钟或数小时内关节功能丧失，不能活动，因剧烈疼痛而屈身不动，形同折叠。部分儿童患者常可缺乏关节疼痛症状，部分病例热退后数月内可再次或反复出现关节痛。
二、其他症状
患者病初常伴有头痛、恶心、呕吐、食欲缺乏，也可见腹痛、腹泻或便秘，全身浅表淋巴结肿大。还会出现鼻出血、牙龈出血、皮肤黏膜瘀点或出血斑、胃肠道出血等，但一般出血量不大。