幽门螺杆菌是存在胃内的一种细菌，有幽门螺杆菌感染时可能会引起上消化道的相关疾病，包括胃溃疡、十二指肠球部溃疡、慢性萎缩性胃炎、胃癌等等，所以在发现幽门螺杆菌感染时，一般常规进行抗幽门螺杆菌治疗。
治疗的方案目前是四联疗法，疗程是两周时间。临床中的药物包括质子泵抑制剂，例如奥美拉唑、兰索拉唑、雷贝拉唑、埃索美拉唑，加上一种铋剂。
可以选择枸橼酸铋钾、胶体果胶铋等等，另外选择两种抗生素，两种抗生素可以有阿莫西林、左氧氟沙星、呋喃唑酮、甲硝唑、替硝唑、环丙沙星、四环素等等，选择其中两种药物。
对于青霉素过敏的病人，不能使用阿莫西林，服药期间注意观察药物的不良反应。一般服药两周以后，然后停药一个月，复查碳13或碳14呼气试验，观察幽门螺杆菌有没有被根治。