治疗方案主要采用糖皮质激素治疗，6~12月的治疗时间，定期复诊，逐渐减停。
1、糖皮质激素类药物：泼尼松是最主要的慢性嗜酸性粒细胞肺炎治疗药物，大多数病例用泼尼松治疗后，6小时内退热，24～48小时呼吸困难、咳嗽和嗜酸粒细胞浸润减轻，低氧血症在2~3天得到缓解，1~2周X线改善，快者2~4天。症状完全缓解在2~3周，X线在2个月内恢复正常。待症状好转和肺部症状吸收后逐渐减量，疗程4~6个月。
2、单克隆抗体：研究表明美泊利单抗、瑞利珠单抗等抗IL-5抗体可以通过破坏IL-5信号减少血液和肺组织中嗜酸性粒细胞计数。虽然目前尚无抗IL-5抗体应用于本疾病治疗的相关报道，但是靶向治疗已成为治疗慢性呼吸道疾病的一种非常有效的方法，针对嗜酸性粒细胞性炎症的新生物制剂将为EP的治疗提供新的方向。