继发性甲亢的治疗需要根据引起的病因来定。像是甲状腺自主高功能腺瘤以及其他原因，如使用含碘药物、垂体疾病等都可以导致继发性甲亢。甲状腺自主高功能腺瘤属于良性肿瘤，但是因其有自主分泌甲状腺激素的结节，而使得甲状腺功能亢进，手术治疗可以将其治愈。而使用含碘药物而导致的甲亢，需要停用含碘药物，甲状腺功能便会恢复到正常范围之内。垂体疾病要治疗垂体相关疾病，垂体疾病治愈之后，甲状腺功能亢进症也会治愈。