甲状腺功能减退症按其病变部位，可分为原发性甲状腺功能减退症、中枢性甲状腺功能减退症和甲状腺激素抵抗综合征；原发性甲状腺功能减退症常见于甲状腺手术、甲亢I131治疗、自身免疫性甲状腺炎（桥本甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎、无痛性甲状腺炎等）、含碘药物（胺碘酮）、抗甲状腺药物（硫脲类、咪唑类等）；中枢性甲状腺功能减退症见于垂体腺瘤、产后大出血、垂体外照射等。甲状腺激素抵抗综合征是甲状腺激素作用于组织器官时抗体识别异常所致。