脑血栓的药物治疗方案，是根据发作时间段的不同而有所不一样，急性脑血栓处于溶栓时间窗内，可以采取溶栓治疗，最常用的药物是阿替普酶，也是目前世界上最认可的溶栓药物。目前规定的溶栓时间窗大多数在4个半小时内，如果错过溶栓时间窗，就只能采取常规药物治疗，包括抗血小板聚集药和调脂药。前者主要是有阿司匹林、氯吡格雷，后者多数使用的是阿托伐他汀钙、瑞舒伐他汀钙、氟伐他汀钠片等。溶栓药物虽然能够使脑血管再通，但是存在一定的出血风险，包括脑出血还有消化道出血。溶栓后的患者，24小时后也需要启动抗血小板聚集药物的治疗，预防脑血栓再次形成。