囊虫病的临床症状根据囊尾蚴寄生部位、数量及人体组织局部反应而不同，多数表现为颅内压增高、局灶神经体征、精神障碍，少数表现为视力下降、视野变化等。囊虫病可并发有癫痫、视神经萎缩、肌肉酸痛、无力症状。
一、典型症状
1、脑囊虫病：皮质型以癫痫为突出症状，严重感染者颅内压升高，出现恶心、呕吐、头痛等症状。脑室型早期表现为颅内压升高，患者在急转头时刻突发眩晕、呕吐或循环呼吸障碍而猝死。蛛网膜下隙型或颅底型初期低热、头痛、呕吐、颈强直等颅内压增高症，以及眩晕、听力减退、耳鸣及共济失调等。
2、眼囊虫病：症状轻者可有视力下降、视野改变、结膜损害、虹膜炎、角膜炎等，严重者可致失明。
3、皮下组织和肌肉囊虫病：有皮下或肌肉内囊虫结节，以头颈和躯干较多，四肢较少，结节呈圆或椭圆形，直径0.5~1.0cm，坚实，可在皮下或肌肉中自由推动，无压痛。结节可陆续出现或自行消失。
二、其他症状
部分患者会出现面神经麻痹、痴呆或死亡。