婴儿肛周脓肿通过使用药物治愈，说明肛周脓肿并不存在内口，有可能是由于皮肤外源性的感染，导致的毛囊急性化脓感染性疾病，就不需要特殊的治疗。大多的婴儿肛周脓肿都有内口，通过抹药等药物的使用控制局部的症状，局部的红肿消退会残留硬结，婴儿也不会感觉到疼痛等不适症状，需要行手术治疗才能完全治愈，手术的目的是将内口打开使其重新生长，后期就不会再次复发肛周脓肿。