肛瘘诊断后是建议做手术的。肛瘘多数是由于肛周脓肿局部破溃或者是单纯切开后形成的慢性肉芽性管道，感染原来源于肛门内的肛腺的感染，做手术需要处理感染原，也就是内口，部分病人可以终生带瘘生存，但是大多数病人会在进食辛辣刺激性食物，熬夜，劳累，抵抗力下降的情况下导致局部反复感染，长期反复有慢性炎症的刺激可导致感染进一步扩散，容易形成复杂性肛瘘，增加手术的难度。部分患者由于炎性的刺激，还有癌变的风险，所以出现肛瘘时还是建议做手术的。