小肠腺癌主要是以手术治疗为主，对于放疗、化疗这两种治疗方法不敏感。对于少数患者而言，进行化疗可以稍微的缓解患者症状，可以给予氟尿嘧啶、丝裂霉素或者顺铂对患者进行治疗，通常需要长期间歇性治疗。
一、药物治疗
小肠腺癌对化学药物治疗不敏感，少数患者可以稍微的缓解症状。
1、氟尿嘧啶：这种药物是以抗代谢物而起作用，在细胞内转化成有效的氟尿嘧啶脱氧核苷酸之后可以阻断脱氧核糖尿苷酸，受细胞内胸苷酸合成酶转化为胸苷酸干扰及DNA的形成。
2、丝裂霉素：丝裂霉素是一种外用抗肿瘤药物，对于实体肿瘤具有抵抗效果。
3、顺铂：顺铂属于细胞周期非特异性的抗肿瘤药物，可以破坏DNA，抑制体内肿瘤的生长，具有抗菌谱广对乏氧细胞有效的特点。这种药物会产生恶心，呕吐，食欲减低和腹泻等不良症状。
二、手术治疗
小肠腺癌的手术治疗的基本原则，是切除患者体内的整块肿瘤所在的肠段以及相应的肠系膜所对应的淋巴结，处于肿瘤晚期的患者则无法进行切除，可以进行旁路手术来缓解患者的症状，并对患者进行介入治疗，以此来控制肿瘤的生长。