当医生怀疑是化脓性颅骨骨髓炎时，将通常进行血常规，如有流脓还将脓液涂片镜检、培养等检查。根据血常规结果，通过头部X线、CT、MRT等检查予以确诊。
1、血常规：检查目的是确认患者是否存在感染及感染程度，是诊断感染性疾病必不可少的项目。
2、头部X线：目的是观察颅骨是否有损伤等，对发现病灶性及感染范围有一定帮助。缺点是敏感度较低，感染早期常无异常变化。
3、头部CT：目的是观察颅骨是否有损伤等，还可以发现颅内是否有脑脓肿并发症，是目前诊断化脓性颅骨骨髓炎最佳诊断方法之一。
4、头部MRI：目的是可观察炎症病灶及软组织，是目前诊断化脓性颅骨骨髓炎最佳诊断方法之一。