卵巢囊肿手术大多数需要1-2个小时左右，卵巢囊肿手术目前绝大多数都可以在腹腔镜下进行，对于既往粘连比较严重、双侧比较大的卵巢囊肿或者可疑恶性，可能需要开腹手术，绝大多数手术都可以在1-2个小时左右完成。
手术时间跟卵巢囊肿的性质、大小，还有既往有无手术史和腹腔内的粘连情况密切相关，大多数手术可以在术后的3-5天左右出院回家，开腹手术的住院时间要延长一点。如果是卵巢的真性肿瘤，需要尽早手术，以明确卵巢囊肿的性质。