小肠镜并非常规的内镜检查，只有通过腹部CT、消化道造影或胶囊内镜提示存在小肠病变，需要进一步检查的病人才需要进行该项检查。小肠镜检查一般需要住院进行，多在手术室麻醉状态下完成。根据上述检查提供的病变位置选择是经口进镜还是经肛门进镜。如果病变在空肠或近端回肠多采取经口进镜，如果病变靠近末端回肠，多采取经肛门进镜。