摩根菌肺炎是由摩根菌感染所导致，故应积极治疗上呼吸道感染等相关疾病。合理应用抗生素及激素，预防感染。尽量缩短住院时间，尽早开始肠内营养和经口进食。
（1）改善生活习惯，如室内保持良好通风，注意保暖，预防感冒。适当参加体育锻炼，增强身体的抗病能力。合理使用抗生素，积极治疗上呼吸道感染等相关疾病。
（2）合理膳食，饮食宜清淡、易消化，摄入一定的优质蛋白，提高身体的免疫力，控制总热量的摄入，可少食多餐，定时定量进餐。