膜增生性肾小球肾炎传统上是根据电镜检查分为I型，II型，III型。但是进一步认识到膜增生性肾小球肾炎发病机制后，目前已重新分类为免疫复合物介导型，补体调节机制异常导致补体旁路途径持续活化型，非免疫球蛋白和补体沉积介导型这三型。最后一型较罕见。免疫复合物介导型的膜增生性上球肾炎的特征是存在免疫复合物后补体成分，可见于慢性感染，自身免疫性疾病和单克隆免疫球蛋白。补体介导的膜增生肾小球肾炎的特征是仅有补体成分，没有免疫复合物沉积，又分为C3肾小球病和C4肾小球病。