腺样囊性瘤以手术治疗为主，配合放疗与化疗。可辅以生物治疗、中医中药治疗与营养治疗，提高治疗疗效。
一、药物治疗
本病以手术治疗、化学药物治疗、放射治疗等手段为主，无一般药物治疗。
二、手术治疗
手术是腺样囊性癌治疗主要的方法。
1、原发灶手术切除术：手术时必须遵循肿瘤外科原则，对恶性肿瘤必须完全、彻底地切除。由于肿瘤浸润性极强，手术中很难确定正常的边界。除手术设计时应常规扩大手术到正常周界外，术中应做冰冻切片检查，以确定周界是否正常。
由于肿瘤易沿神经扩散，腭部肿瘤手术时应将翼腭管连同肿瘤一并切除。下颌下腺肿瘤手术应追踪性切除舌神经。
2、选择性颈淋巴清扫术：腺样囊性癌颈淋巴结转移率很低。因此一般不必做选择性颈淋巴清扫术，但位于舌根部的腺样囊性癌淋巴结转移率较高，可考虑行选择性颈淋巴清扫术。
三、放射治疗
单纯放疗不能达到根治，但配合术后放疗可明显降低术后复发率，提高患者生存率。腺样囊性癌常不易手术切净，导致肿瘤细胞残存。因此，术后常需配合放疗。
四、化学药物治疗
腺样囊性癌易侵入血管，造成血行性转移，转移率高达40%。因此，腺样囊性癌患者术后可采用化疗，预防血行性转移。除此之外，药物可以单独使用，也可以联合使用，术后防治癌症复发。化疗常有不良反应，如白细胞减少、凝血异常、食欲减退、恶心、呕吐、腹泻或腹痛等。
1、细胞毒素类：主要药物是氮芥、环磷酰胺。
2、抗代谢类：常用药物有甲氨蝶岭、氟尿嘧啶等。
3、抗生素类：常用的有博莱霉素、平阳霉素、阿奇霉素、阿霉素等。
4、激素类：常用的为肾上腺皮质激素类。
5、植物类：常用的有长春新碱、长春地辛、羟基喜树碱以及紫杉醇等。
6、其他：甲基辛阱、羟基脲、顺铂等。
五、营养治疗
给患者静脉输入高营养液，可使癌患者的免疫功能明显提高。手术后的患者，在给予高营养液补充后恢复快，创口愈合加速。高营养补充后肿瘤虽加速增殖，但对化学抗癌药物的敏感性增加，从而可提高疗效；对于放射治疗的敏感性也有增加。有些患者因营养不良而无法进行较大剂量抗癌治疗，在高营养治疗后体质改善，就能忍受抗癌治疗。因此营养疗法已成为抗癌治疗的一种辅助手段。一般在补充高营养后1~2周施行抗癌药化疗或放射治疗，效果较佳。
六、中医治疗
中草药：如人参、黄芪、女贞子等，也可通过调节机体自身功能而实现治疗效用。中药中有不少免疫增强剂或免疫调节剂，均有待今后进一步的发掘与研究。
七、其他治疗
1、免疫治疗：此类药物有细菌菌苗、胸腺素、单克隆抗体、淋巴因子，转移因子以及免疫核糖核酸等。可提高机体对癌细胞的免疫能力，但疗效不稳定。
2、细胞因子治疗：此类药物有白细胞介素-2、肿瘤坏死因子以及干扰素等。它们是在细胞因子水平上进行的所谓生物应答调节，具有只杀伤肿瘤细胞而不损伤机体正常细胞的特点，但不常用。