多发性软骨瘤没有特殊的治疗方法，对于有并发症的患者，如病理性骨折，可采用手术的方式来治疗。
一、一般治疗
针对无临床症状患者，可以不予特殊治疗，但应密切随访观察，同时注意检查大脑及腹部有无隐匿性损害。
二、药物治疗
本病以手术治疗为主，无药物治疗。
三、手术治疗
1、手术适应证：病变部位疼痛、肢体进行性畸形或恶变倾向、恶变者。
2、手术方式：
（1）病灶刮除、植骨术，主要针对有疼痛的病灶，可同时活检排除恶变可能。
（2）骨骺阻滞术，主要针对清除发育期畸形进展较快的患者。
（3）截骨矫形或肢体延长术，主要针对已经存在的肢体内、外翻畸形，或肢体不等长。
（4）根治性手术，主要针对恶变者，可做病变彻底切除，或截肢。