微小病变型肾病的预后差异较大。患者对激素治疗的反应也有很大的差异，有些患者能迅速缓解，且不再复发；有的患者则在反复复发的过程中，由原来对激素敏感发展至激素依赖甚至激素抵抗。如果患者反复复发，可能出现病理转型，转为局灶节段性肾小球硬化，治疗效果差，就可能出现各种并发症，可能影响肾功能，导致血肌酐升高，预后差。