自身免疫性肝炎的发病因素尚不明确，目前认为是遗传易感性和环境因素的共同作用，导致自身免疫功能异常，进攻自身肝脏细胞，导致肝损伤。
增加患病的因素是病毒感染、酒精、药物等，均可增加患病的几率。
高风险人群为存在自身免疫性疾病患者，中年女性多见，因免疫系统功能缺陷，导致肝细胞的自身免疫反应，从而引起肝细胞损伤。