脑膜炎鉴别的方法主要依靠腰穿、脑脊液检查，脑脊液检查的鉴别主要表现在以下几个方面：
第一、脑脊液的压力，病毒性脑膜炎压力正常或轻度升高，化脓性脑膜炎压力升高明显，结核性脑膜炎压力轻度升高。
第二、细胞数，病毒性脑膜炎的细胞数在100×10^6/L以下，以淋巴细胞为主；化脓性脑膜炎的细胞数在（1000-10000）×10^6/L，以中性粒细胞为主；结核性脑膜炎的细胞数在（50-500）×10^6/L，以淋巴细胞为主。
第三、脑脊液蛋白，病毒性脑膜炎的蛋白正常或轻度升高，化脓性脑膜炎的蛋白升高，结核性脑膜炎的蛋白中度升高。
第四、糖和氯化物，病毒性脑膜炎正常，化脓性脑膜炎降低，结核性脑膜炎也呈现降低。