脑室炎的治疗至今仍是棘手问题，一旦发病，应尽早查清致病菌及药物敏感试验，以便选用能透过血脑屏障的强效抗生素及药物，此外还需脑室置管持续冲洗引流，配合全身用药，同时积极治疗病因。
一、药物治疗
抗生素类药物用于消灭颅内和全身的细菌，改善炎性症状。根据药敏试验结果，可选用针对性药物，如阿莫西林、头孢哌酮等。若脑室积脓，则需用置管引流或行双管冲洗引流，使用庆大霉素进行治疗，缓慢持续冲洗，直到引流液转清，症状好转，细菌培养阴性及白细胞数正常。选择抗生素，一般都按规定，通过血液脑脊液等验出或培养出菌种，做菌种药敏实验，选择对菌种敏感性高的抗生素对症下药效果会好很多。
二、手术治疗
位于脑深部接近脑室的脓肿，紧急开颅切除脓肿，用抗菌盐水彻底冲洗脑室，并置管行脑室外持续引流，同时，全身加强抗菌治疗，尚有一线救治希望。
三、其他治疗
1、脑室置管持续冲洗引流，可以保持脑室内及蛛网膜下腔的有效药物浓度；还可降低颅内压，减轻因残留细菌或其他物质刺激脑室，防止蛛网膜的炎性粘连。
2、根据患者情况采取降颅压，降温及镇静措施，纠正水电解质紊乱等。