百草枯中毒最严重的损伤表现在肺，人体中毒后，百草枯在肺内的浓度是血浓度的10-90倍，这主要由于肺内氧含量高而抗氧化剂浓度低，因而对肺组织具有较强的亲和力。同时肺损伤的程度与口服剂量和血液浓度呈正相关。中毒后，早期肺的改变以渗出为主，中期逐渐出现纤维化，按病情轻重表现为局限性条索影、多发纤维灶，严重者出现间质纤维化。