新生儿肺炎感染病原体因感染途径不同病原体也不同。产前感染多数通过羊水和血行传播，病原体称为b型溶血性链球菌，革兰阴性杆菌，巨细胞病毒、弓形体等为主。产时胎儿在娩出过程中吸入母亲阴道分泌物，病原体以革兰阴性杆菌、沙眼衣原体感染为主。特别注意沙眼衣原体感染肺炎生后数周才出现临床症状。出生后感染途径主要为患儿本身脐炎、皮肤感染、败血症通过血行传播引起以革兰氏阳性菌为主；当与呼吸道感染者密切接触交叉感染，从上呼吸道感染向下蔓延引起，以病毒感染为主，但容易继发细菌感染革兰阳性菌。