1、乳管镜检查：从溢液乳管口处放入纤维乳管镜，借助电视屏幕可直接观察溢液乳管的上皮及管腔内的情况，并可酌情进行活检，极大地提高了乳腺导管内乳头状瘤的诊断准确性，为需要手术的患者提供肿瘤的准确定位。
2、乳腺导管造影检查：乳腺导管造影是将造影剂注入溢液导管后摄片，乳腺导管内乳头状瘤显示导管突然中断，断端呈弧形杯口状影像，管壁光滑完整，可见到圆形或椭圆形充盈缺损，近侧导管显示明显扩张。由于乳腺导管造影不能直接观察导管上皮及导管腔内的病变，目前许多大医院已不再使用，诊断乳管内病变通常采用乳管镜检查。
3、乳腺超声检查：对较大的导管内乳头状瘤彩超可见到扩张的导管和肿瘤影像。
4、脱落细胞学：乳头溢液细胞学涂片检查是通过采集乳头溢液，制成细胞学涂片，经显微镜观察，了解病变的细胞学特征，如能找到瘤细胞则可明确诊断，阳性率较低但可重复进行。
5、高频彩色多普勒超声：高频彩色多普勒超声是导管内乳头状瘤有效的检查方法, 可以对乳腺导管内乳头状瘤作出较明确的诊断和定位，可作为隐匿性导管内乳头状瘤的首选检查方法。
6、乳腺钼靶X线检查：是目前诊断乳腺导管内乳头状瘤的较可靠的方法。
7、磁共振：磁共振可以对肿瘤大小，肿瘤位置做出有价值的判断，是临床诊断乳管内乳头状瘤的重要辅助手段。
8、手术活检：手术活检能早期发现乳管内微小病变，是一种诊断率较高的方法。
9、针吸细胞学检查：对于可触及肿物的病例，采用针吸细胞学检查，观察到瘤细胞即可确诊，准确率比较高。