肌肉萎缩分为肌源性、神经源性、废用性及其他，主要根据病因治疗，采取一系列规范的康复锻炼。肌源性肌肉萎缩避免使用能引起肌酶增高的药物，例如他汀类药物，主要累及四肢的近端，如股四头肌。神经源性肌萎缩可给予营养神经药物，例如B族维生素，维生素B1、维生素B6、维生素B12等。废用性肌萎缩大部分由于脑血管病后遗症，主要采取康复功能锻炼。其他因素导致的肌肉萎缩，例如接触有毒物质导致的需要脱离有害环境，针对不同有毒物质采取不同药物。