十二指肠溃疡的典型临床表现是上腹部节律性疼痛，患者主要表现为饥饿痛和夜间痛，进食后腹痛的症状能明显缓解。同时，患者会伴有食欲不振、消化不良、反酸、烧心、恶心、呕吐等其他症状。
十二指肠溃疡的病人有些可以出现消化道出血，表现为呕血或者黑便。慢性十二指肠溃疡患者往往合并幽门梗阻，表现为进食后腹胀、呕吐，呕吐物往往是隔夜的宿食。