1、腹部超声：儿童肠套叠首选超声，无创、经济，而且准确率高。
2、空气或钡灌肠：既可以作为检查手段，也可以是一种治疗手段，但该检查属于有创操作。且伴有肠穿孔的可能，故没有超声普遍。
3、腹部CT：成人较常用，因CT有辐射，故儿童不作为首选，肠套叠在CT下可变现为同心圆征。
4、电子结肠镜：属有创操作，当腹痛，便血病因不明确时，可作为诊断性检查方法。
5、腹部X线平片或透视：可观察肠腔内积气，肠梗阻及腹腔渗液情况，对指导空气和钡剂灌肠复位有重要意义，如腹腔内有游离气体或肠梗阻较严重时为空气或钡剂灌肠复位的禁忌证。
6、B超：在套叠部位横断扫描可见同心圆或靶环状肿块，纵断扫描可见“套简征”。