甲真菌病往往发生在皮肤真菌病之后，因此预防甲真菌病的发生首先要预防和积极治疗皮肤真菌病，包括穿透气吸汗性良好的鞋袜，注意个人卫生，保持局部皮肤清洁干爽，不与他人尤其是皮肤真菌病患者共用个人卫生用品，不用公共场所的毛巾拖鞋等物品，不裸足在公共场所尤其是潮湿封闭的环境里行走等，这样可以预防发生皮肤真菌感染。而一旦发生了皮肤真菌感染，如出现手足癣要积极的进行抗真菌治疗，可以避免甲真菌病的发生。出现甲外伤后局部抵抗力下降，真菌容易植入而发生甲真菌病，所以应避免甲外伤，也可预防甲真菌病。