洋葱假单胞菌肺炎的总体治疗为长期持续性治疗，控制症状后也需要康复期。一般治疗以辅助通气治疗为主，药物治疗以妥布霉素、头孢他啶、沙丁胺醇气雾剂、米诺环素为主。其他治疗以戒烟戒酒和做好个人防护为主。
一、一般治疗
一般治疗以辅助通气治疗为主，对症缓解呼吸困难症状。
二、药物治疗
1、妥布霉素：早期应用的首选药物，对于洋葱假单胞菌的杀灭有着很强的作用，相关研究表明对于本病的控制和预后的改善有着较强的作用。
2、头孢他啶：对于本病治疗的经验性用药，头孢他啶的覆盖病菌范围较为广泛，可在治疗过程中观察情况，控制不佳时及时换药。
3、米诺环素：对于本病的经验性用药，也有相关研究表明对于洋葱假单胞菌有着较好的杀灭作用，可联合其他药物使用。
4、沙丁胺醇气雾剂：典型的缓解支气管痉挛药物，对于本病患者发病过程中的呼吸困难有着显著的缓解作用，同时也可促进患者的康复。
三、手术治疗
本病无手术治疗方案。