一般来说，在体检中发现癌胚抗原偏高常常是多种原因所导致，比如在恶性肿瘤中可以见到癌胚抗原偏高，这些常见的恶性肿瘤主要包括结肠癌、直肠癌、胰腺癌、胃癌、非小细胞肺腺癌和乳腺癌。
除了常见的癌症之外，体检发现癌胚抗原数值偏高可以发生在良性疾病，比如肝硬化、直肠息肉、溃疡性结肠炎，就可以出现癌胚抗原偏高的现象。此外，一些良性乳腺疾病的病人体内也可以检测到癌胚抗原数值偏高。当癌胚抗原的数值比正常值持续升高5-10倍，甚至10倍以上时，就会强烈提示有恶性肿瘤存在，临床上癌胚抗原更大的临床意义主要在于观察抗肿瘤治疗疗效以及判断预后，可以用来及时发现癌症复发或者转移的情况。