甲状腺功能减退主要是由于自身免疫功能紊乱产生一些自身免疫性的抗体，对甲状腺有破坏作用。还有一些是原发性甲状腺功能减退，抗体也不高，但确实出现了甲状腺功能减退的症状，化验检查也有异常，出现这种情况需要治疗。
一旦诊断明确的甲状腺功能减退，需要长期补充甲状腺素，甲状腺素从小剂量开始，服用一段时间要化验甲状腺功能。如果甲状腺功能正常了，就按目前的量维持，然后三个月到半年复查一次。如果吃的量不够，需要加量，如果甲状腺功能偏高，属于药物性甲亢，需要减量，所以要定期监测。