扁桃体炎与慢性咽炎是两种不同的疾病。扁桃体炎主要表现为双侧扁桃体的急、慢性炎症，表现为扁桃体的肥大增生或扁桃体化脓，反复的扁桃体发炎可能会引起全身的并发症如心肌炎、肾炎、关节炎等。慢性咽炎主要表现为咽后壁黏膜淋巴滤泡增生，症状多表现为咽部的异物感、梗阻感、痰粘着感，也可见咽干不适等症状。总之，两者部位不同，发病时症状也不同。