慢性直肠炎主要分为感染性炎症以及非感染性炎症两大类。如果患者同时合并发热、脓血便之类症状，要首先考虑感染性疾病所导致的症状，一般建议针对粪便进行感染微生物的培养分离检查，根据感染的病原微生物种类以及药物敏感性进行抗感染治疗。如果同时合并直肠脓肿等严重感染症状需要进行手术治疗。如果患者属于慢性非感性直肠炎症，一般建议在医生指导下应用免疫抑制类药物进行处理，如西药不能耐受，可以在正规中医处进行中药灌肠治疗。