质子放疗的效果与光子放疗(常规放疗，IGRT，IMRT等电子直线加速器放疗)的效果相比，反应更轻，重要器官保护好，放疗效应更高。以上特点主要来源于质子放疗剂量曲线及生物效应。质子放疗特点在靶器官后方剂量少，所以靶器官后方组织得到保护，而光子不能。光子放疗时受到氧含量影响，乏氧细胞对放疗不敏感，而质子放疗在这方面影响小。