胃肠神经官能症指的是功能性胃肠病，功能性的胃肠病是指无法用器质性的疾病来解释患者的症状。在临床工作中很大一部分病人是功能性的胃肠病，功能性的胃肠病包括十几种的疾病，包括功能性的消化不良、功能性腹胀、功能性便秘等。
每种疾病的治疗方法也不太一样，没有特别有效的治疗，主要是针对症状，进行经验性的治疗，比方以腹胀为主的病人，可以给予帮助消化、减少肠道气体的药物，如各种消化酶，或促进胃肠道蠕动的药物，如多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等。对于便秘的病人，可以给予调节肠道蠕动的药物，如莫沙必利、曲美布汀以及软化大便的药物等，每种功能性的疾病，其治疗方案是不一样的，需要到医院进行相关的咨询，制定治疗方案。