肝性脑病昏迷患者的治疗应该积极治疗原发病，维持机体的功能，消除各种诱发肝性脑病的因素，纠正各种代谢障碍和防治并发症。
一般治疗是指加强保肝治疗，注意水电解质及酸碱平衡，需要减少体内氨的产生，如给予清洁灌肠，改变肠内环境，减少氨的吸收，可使用乳果糖治疗。
除此以外需应用去氨药物治疗，常用的去氨药物有谷氨酸、精氨酸、乙酰谷酰胺和门冬氨酸钾镁等，还可使用改善和恢复脑细胞功能的药物，如使用支链氨基酸治疗，其他措施包括透析或者灌注疗法。