如果是HPV16阳性、CINⅡ级要行手术治疗，可以治愈。行宫颈冷刀锥切或者利普刀切除宫颈病变组织，术后三个月要再次进行HPV和TCT的检查，大多数病人在手术后HPV和TCT转阴。如果在手术后HPV16仍未转阴，可以给予抗病毒的药物阴道上药进行治疗，定期进行复查直至高危型HPV16转阴再停止治疗，但仍要每隔3-6个月进行TCT及HPV的复查。
HPV病毒不一定要治疗，一般不需要治疗HPV病毒，而要治疗病毒感染引起的病变，也没有治疗HPV病毒的特效药。高危型HPV病毒可能引起宫颈癌、外阴癌或者肛门癌，低危型可能引起尖锐湿疣。人一生中感染HPV的概率是80%，但是80%-90%的人两年内可以自我清除掉，年轻者清除能力更强。