结肠炎一般不需要使用消炎药，但对于重度溃疡性结肠炎的患者，在急性爆发期时需要使用消炎药，控制肠道或者防止肠道的继发性感染。
在临床上比较常用的消炎药包括硝基咪唑类的药物，有甲硝唑、奥硝唑、替硝唑等等，主要是预防厌氧菌的感染。也有一些喹诺酮类的药物，包括左氧氟沙星、氧氟沙星等等，这类药物为广谱的抗菌药物。
另外，还有氨苄青霉素以及头孢类抗生素等等。患者可以通过自身感染症状的严重程度选择相对应的抗生素，必要时也可以联合用药。