垂体性闭经的病因有很多，如垂体梗死、垂体功能损伤、垂体肿瘤等，以及精神影响、环境因素共同参与其发病。
一、主要病因
1、垂体损伤：由头颅损伤或颅内手术、放射、炎症等原因使垂体损伤引起垂体功能减退，卵巢功能低下，导致闭经。
2、垂体肿瘤：系器质性疾病中引起闭经的最常见原因。
3、垂体梗死：常见的为席汉氏综合征，由于产后大出血休克，垂体缺血坏死，尤以腺垂体最敏感，造成各个腺体功能异常，卵巢功能异常表现为闭经。
4、空蝶鞍综合征：由于垂体外的保护膜先天发育不全或被肿瘤、手术破坏，可能会使脑内循环的液体涌入，将垂体压扁，引起闭经。
5、地中海贫血、淋巴性垂体炎：地中海贫血、淋巴性垂体炎等疾病也与垂体性闭经的发生有关。
二、诱发因素
1、持续较长时间哺乳：女性生产后长时间持续哺乳可能会发生垂体性闭经。
2、精神方面因素：当精神长期出现消极情绪，如恐惧、抑郁、焦虑等情况时，大脑、下丘脑就会发生功能性失调，从而导致垂体性闭经。因此，针对这种原因导致的垂体性闭经，患者要及时主动调整好自己的心态。
3、药物导致：有些药物会影响到下丘脑的内分泌功能，因此，当有可疑情况时要及时咨询医生，看是否由相关药物引起。
4、产后大出血：产后大出血没有及时纠正。