1、血常规检查：若发现白细胞总数及中性粒细胞百分比升高，提示细菌感染；若不增高，可能为病毒感染。
2、病原学检测：咽拭子、粪便或疱疹液标本检测肠道病毒或检测血清特征性抗体浓度，大于正常参考值上限考虑有病毒感染。病毒的分离培养是诊断的金标准，但其阳性率低，临床不常用。
3、体格检查：医生通过用压舌板压住舌头，观察患者咽峡，可观察到患者是否有咽峡或是扁桃体的溃疡等，并能初步了解病情的程度。