花椒属于味辛，性温热，能够温中散寒、除湿止痛的一种药食两用的调味品，所以常喝花椒水可以提高人体的免疫力，花椒的温热特性可以用来驱寒，用花椒煮水喝可能缓解寒凉病因引起的胃痛及痛经等。根据花椒抑制细菌的特点，也适用于因为细菌感染咽部后引起的打鼾症，可能会有意想不到的效果。
另外，花椒有麻醉作用，在牙痛时也可以含漱花椒水来进行止痛。花椒中所特有的挥发油在人体内可以提高人体巨噬细胞的吞噬作用，能够增强人体免疫系统的功能，并且花椒可能抑制某些细菌和真菌的活性，有一定的消炎作用，尤其是对白喉杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎球菌的抵制作用比较明显。