由于腭癌的病因和发病机制尚未完全阐明，目前仍缺乏病因治疗。临床中主要遵循早期和长期、积极而理性、综合治疗和全面达标、治疗措施个体化等原则，患者治疗多数为综合序列治疗，周期较长，治疗后需要长期追踪随访。
一、药物治疗
1、细胞毒素类(烷化剂)，主要药物是氮芥、环磷酸等。
2、抗代谢类常用药物有甲氨蝶呤、氮嘧啶。
3、抗生素类常用的有博来毒素、平阳霉素、阿霉素、表阿霉素等。
4、激素类常用的为肾上腺皮质激素。
5、植物类常用的有长春新碱、长春地辛、羟基喜树碱、紫杉醇等。
6、其他有甲基苄肼、羟基原、顺铂等。
二、手术治疗
1、原发腭癌：早期病损应行包括腭骨在内的病变扩大切除术。对腭骨破坏或上颌窦底受侵者，应行上颌骨次全切除术。病变已侵入上颌窦者应行上颌骨切除术。已有淋巴结转移者行根治性颈淋巴结清扫。病变范围扩大，临床虽未扪及肿大淋巴结，可考虑选择性颈淋巴结清扫。原发灶手术切除后，多应用赝复体恢复缺损和牙列，对选择性病例可行腭成形术。腭癌原发灶手术切除后，一般应用修复体(赝复体)恢复缺损和牙列，对部分病例可选颞肌瓣转移修复术，目前还可以选择带蒂或游离皮瓣修复组织缺损。
2、转移腭癌：硬腭癌的颈淋巴转移率在40%左右；晚期病例常发生双侧颈部转移，术式可采用一侧或双侧功能性颈清术。双侧颈清术可视患者病情采取同期或二期颈清术。术前未发现颈部淋巴结转移者也可以行选择性颈清术。
三、放射治疗
射线照射组织，可引起一系列的细胞电离反应，使病理组织受到破坏，特别是分化较差的细胞，更容易受到放射线的影响。正常组织细胞虽然也受到一定的损害，但仍可恢复其生长和繁殖的能力；而肿瘤细胞则被放射所破坏，不能复生。由于核科学的迅速发展，目前各种放射性核素都逐渐被应用到临床上来，丰富了放射治疗的内容。放射治疗的疗效也有了很大程度的提高。现在常用于放射治疗的放射源有Co、P、Au、Ga、Tc等、加速器以及中子放射源等。治疗方式主要有外照射及腔内照射两类。口腔颌面部肿瘤的放疗以Co及5MeV的直线加速器为最常用。
四、其他治疗
在肿瘤扩大根治术后，对于那些全身情况不允许长时间行立即整复手术，不能行立即整复的病例，则可用配戴修(赝)复体，也称人工弥补物，以协助患者在术后能维持和恢复一定的功能和外貌，这种方法亦称为赝复治疗。