胰岛素自身抗体阳性通常提示存在1型糖尿病，另外也可见于胰岛素自身免疫综合征。
1.1型糖尿病：由于自身免疫反应损伤胰岛β细胞，使胰岛β细胞逐渐丧失分泌胰岛素的能力，最终引起血糖代谢紊乱，是一种慢性自身免疫性糖尿病，而胰岛素自身抗体阳性正是胰岛β细胞破坏的结果。
2.胰岛素自身免疫综合征：发病机制尚未完全明确，可能是由于在易感基因的背景下，出现免疫缺陷和药物诱发起病，诱发因素包括病毒感染及药物，如腮腺炎病毒、柯萨奇病毒B、丙型肝炎病毒、风疹、麻疹和水痘病毒等，这些超级抗原可触发机体产生胰岛素自身抗体，导致检测时呈阳性。