新生儿指甲根部发紫常见的原因有，新生儿穿得过少，室温过低，使孩子的体温过低，末梢循环不好，出现了指甲根部发紫。新生儿手局部血液循环不好，有缺血缺氧；新生儿有感染性疾病、心肺系统疾病，比如呼吸衰竭、呼吸衰竭或脓毒症性休克等，都有可能因为缺氧而导致指甲根部发紫；先天性心脏病，如室间隔缺损，房间隔缺损，卵圆孔未闭，瓣膜关闭不全等；血液系统疾病。