钩端螺旋体病的治疗药物，首选为青霉素类抗生素，轻症患者可以应用阿莫西林，氨苄西林口服，重症患者可以应用青霉素注射。除了青霉素外，或者青霉素过敏的人群，轻症患者还可以应用多西环素，阿奇霉素等口服，重症患者可以应用头孢曲松或头孢噻肟钠进行静脉注射，疗程均为7天。喹诺酮类药物对钩端螺旋体病也有一定的效果。青霉素治疗后容易发生赫氏反应，这是由于大量的钩体被青霉素杀灭后释放毒素所致，会出现高热、寒战、头痛，心率和呼吸加快，严重的还会出现休克等表现，所以，应用青霉素一般从小剂量开始。