婴儿猝死综合征的原因，常见有以下几方面：
1、脑干发育异常或发育不成熟：是临床上最常见原因，使得婴儿的呼吸和觉醒存在障碍，导致婴儿出现乏氧和二氧化碳潴留，从而导致其出现猝死的情况。
2、先天免疫系统存在缺陷：婴儿免疫系统所产生的白细胞和蛋白质的数量，可能都会明显地高于正常水平，而其中的蛋白质，可能会在大脑睡眠期间，改变婴儿的心跳和呼吸频率，导致婴儿进入深度睡眠状态，甚至会导致婴儿出现昏迷、猝死的情况。
3、先天性新陈代谢紊乱：婴儿的机体可能无法正常处理体内各种酶学或酸性物质，从而导致机体发生致死性的酸碱失衡或电解质紊乱。