艾灸时间太长其实对人体有影响，会打破身体阴阳平衡，产生副作用。比如本身阴虚的人，艾灸后短时间内会有阳气提升的效果，而阳气过盛的人，往往也很容易出现阳气旺盛，导致精神亢奋、失眠的问题发生，所以艾灸本身是一个调整人体阴阳的手段，但若是过度使用，会使得本身阴虚的症状变成阳亢的症状，就等于将一种病治成了另外一种病。
初次艾灸的人每个穴位灸10-15分钟是最好的选择，然后根据身体的适应能力再逐渐增加时间，这样循序渐进的方法，不会贸然影响到身体内的平衡，通过艾灸一段时间，身体适应后可以逐渐延长艾灸的时间，对于寒性体质的人，艾灸时间是可以适当延长。