乙型流行性感冒的潜伏期为数小时至4d，一般为1~3d。潜伏期后起病急骤，患者可出现发热、头痛、肌痛、咽痛及全身不适，可伴有腹泻、呕吐等。
起病急，可有发热（体温38～40℃）、畏寒、寒战、乏力、食欲减退、、头痛、头晕、全身酸痛等感染中毒症状，同时伴有咽干、咽痛、干咳等上呼吸道局部症状。部分伴有鼻塞、流涕等呼吸道卡他症状。少数病例有恶心、呕吐、腹痛、腹胀、腹泻等消化道症状。乙型流感整体病情较甲型流感轻。