硝酸咪康唑软膏可以用来治疗包皮龟头炎，主要针对的是白色念珠菌感染所导致的包皮龟头炎。感染性包皮龟头炎致病的病原微生物有很多种，包括了白色念珠菌、滴虫、衣原体、支原体和各种细菌。无论哪一种病原微生物所导致的包皮龟头炎，其治疗的原则一致，主要的治疗原则是抗菌消炎、内外兼治。
白色念珠菌性包皮龟头炎，其口服的药物主要是曲古霉素和伊曲康唑。对于外用的药物，可以选择咪康唑软膏等咪唑类的软膏涂抹局部，还可以选择碳酸氢钠溶液来清洗患部，从而达到内外兼治的效果。